IDN je jedina nacionalna referentna institucija u Srbiji za FRANET, multidisciplinarnu istraživačku mrežu Agencije Evropske unije za osnovna prava (European Union Agency for Fundamental Rights). Članice FRANET-a su istraživačke institucije iz zemalja članica EU i zemalja kandidata, Albanije, Severne Makedonije i Srbije.
Na zahtev FRANET-a, istraživačke institucije obezbeđuju podatke o različitim pitanjima u vezi sa ostvarivanjem osnovnih ljudskih prava kako bi doprineli komparativnim analizama koje sprovodi FRA.
Kao nacionalna referentna institutcija, IDN periodično sprovodi istraživanja i daje pregled aktuelnog stanja ljudskih prava u Srbiji i tako doprinosi praćenju zaštite ljudskih prava od Agencije EU. Neke od tema koje su obuhvaćene navedenim istraživanjima jesu pitanja osnovnih prava, civilno društvo, učešće građana u donošenju odluka, pravo na slobodu udruživanja, okupljanja i izražavanja, položaj osoba pogođenih rastućim troškovima života, pristup pravosuđu, prava na azil i migracije, rodna ravnopravnost, zločin iz mržnje, prava osoba s invaliditetom, prava LGBTI osoba, rasizam i netolerancija, prava Roma itd.